Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms