Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms