Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms