Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms