Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms