Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim41Q5NCC3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms