Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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