Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms