Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2Q3V1H1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms