Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms