Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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BC051142Q3V0M8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BC051142Q3V0M8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BC051142Q3V0M8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BC051142Q3V0M8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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