Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms