Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbof1Q3V079 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms