Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms