Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms