Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms