Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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