Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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