Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms