Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms