Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms