Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms