Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms