Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf40Q3U319 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf40Q3U319 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf40Q3U319 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf40Q3U319 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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