Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms