Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms