Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms