Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms