Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fubp3Q3TIX6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fubp3Q3TIX6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms