Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afvQ3THW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms