Protein–RNA interactions for Protein: Q2WG77

Ripply1, Protein ripply1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply1Q2WG77 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply1Q2WG77 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms