Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrriq3Q14DL3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Lrriq3Q14DL3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Lrriq3Q14DL3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrriq3Q14DL3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Lrriq3Q14DL3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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