Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms