Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms