Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms