Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms