Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms