Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms