Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms