Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aplp2Q06335 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms