Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms