Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms