Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms