Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfdn6Q03958 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfdn6Q03958 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pfdn6Q03958 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pfdn6Q03958 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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