Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms