Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms