Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms