Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms