Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VcpQ01853 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms