Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms